Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dpf3P58269 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms