Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp25P57080 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp25P57080 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms