Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rad23bP54728 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23bP54728 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rad23bP54728 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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