Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Lbx1P52955 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lbx1P52955 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Lbx1P52955 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Lbx1P52955 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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