Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms