Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FmodP50608 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FmodP50608 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FmodP50608 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms