Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LtbrP50284 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms