Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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