Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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