Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VdrP48281 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VdrP48281 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VdrP48281 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VdrP48281 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VdrP48281 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VdrP48281 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms