Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrprbP47758 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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