Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms