Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NapbP28663 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NapbP28663 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NapbP28663 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms