Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd10P28359 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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