Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms