Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gria1P23818 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms