Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PparaP23204 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PparaP23204 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PparaP23204 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PparaP23204 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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