Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prim1P20664 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms