Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa-rs1P17533 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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