Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms