Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gabra6P16305 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gabra6P16305 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms