Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Irf1P15314 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Irf1P15314 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irf1P15314 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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