Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms