Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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