Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01644 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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P01644 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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P01644 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01644 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P01644 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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