Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Foxq1O70220 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms