Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffaO54786 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DffaO54786 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DffaO54786 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DffaO54786 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DffaO54786 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DffaO54786 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DffaO54786 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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DffaO54786 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DffaO54786 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms