Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms