Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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