Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Prrt1O35449 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Prrt1O35449 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Prrt1O35449 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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