Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cnih1O35372 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cnih1O35372 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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