Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
EllO08856 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
EllO08856 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
EllO08856 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms