Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ascl4M0QW46 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms