Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm20830J3KML6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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