Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20828J3KMI7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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