Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms