Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrcG5E8J6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrcG5E8J6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrcG5E8J6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrcG5E8J6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HrcG5E8J6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HrcG5E8J6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HrcG5E8J6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms