Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms