Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms