Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms