Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms