Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm3543D3Z235 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3543D3Z235 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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