Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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