Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms