Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf3B2RQG2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms