Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms