Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prr29B1ARI9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr29B1ARI9 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms