Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F0

Ttll7, Tubulin polyglutamylase TTLL7, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll7A4Q9F0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll7A4Q9F0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms