Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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