Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms